馬偕博士曾於1879年3月26日訪問了枋橋頭(今板橋)林本源邸宅。再於1882年4月間來枋橋行醫傳教設立本教會。
初時租福德街的民房為聚會處，當時的板橋叫枋橋，迷信非常，傳教艱苦，教會並沒有什麼進展，仍然是巡迴佈道站而已。後來教會遷到湳仔，在一次水災之中，教堂被流失，當時愛主的兄姐有廖養執事、石金獅長老，另一位信徒在人們的記憶中被遺漏，他們各奉獻一百龍銀，加上教會少許基金而買下了後菜園街的教堂。在後菜園街教會史，最出色的傳道人就是袁新枝牧師，師母乃是助產士，服務社會，賺錢補貼家庭生活及孩子的教育。在袁牧師二十二年的福音佳美腳縱，結下了纍纍的果實，當袁牧師退休後，教堂已容納不下，為了教會的發展，積極地重建，後來想到袁師娘在明德街的助產院，以土地交換方式，再補貼差價十六萬五千元達成協議。
教會發展主要分成三個階段，詳述如下：
一、福德街時代，1882~1908，共16年
其教會的型態為傳教師的「巡迴站」，大部份都是由外國的宣教師輪流來主持主日禮拜。到這個時期末葉，可能有陳添桂和李順傳道曾經短期駐牧本期。
二、湳仔時代，1908~1909，約2、3年
當時由於遭受水災，教會被大水災流失，不得已只好再遷移。由熱心愛主的廖養執事、石金獅弟兄弟、及另一位各奉獻一百兩龍銀，加上教會積存的基金，共同買下后園街的教會。
三、後菜園時代，1909~1964，共54年
這個時代教會的發展平凡，因傳道者的工作時間都不長，因此教會根基沒法打得堅強。這段時期已袁新枝牧師駐堂最久，前後共有22年之久，袁牧師牧會的特色就是家庭事的佈道，本會目前有幾家信徒信仰堅定的，都是受袁牧師個人家庭事佈道的成果。當時教會沒有經濟力量支持他們的生活，但是他還是勤勉為主做工，在最不景氣石，其經濟來源大都由源牧師娘以接生所提供。袁牧師還把還是艋舺教會支會的板橋教會會友的陣容（特別是質的方面）堅強起來，本來被鄉界認為是貧窮人聚會的地方，開始友鄉深入會，教會的燈塔在社會上的亮光越來越亮，使內心空虛徬徨的人刻下清楚的印象：教會就是得平安的地方，當時的馬偕醫院是台北設備最好的醫院，板橋一些患者有人前往就醫，在那裡認識了耶穌的福音者不少。出院後多多少少都會來教會採望和尋道。到目前，因而來教會的信徒仍不少。其他如徐春生牧師和郭樹枝牧師那時致力參與北部全體教會推動的社教五十年紀念事工如交通佈道的事工，非常賣力。這段時期諸先輩的努力支撐，無人不稱讚，宣道使命的差遣披漫了整個北部教會，板橋教會也是。在這段時期的前大半段艋舺教會支會，直到袁新枝牧師的時期後1950年才升格成為堂會，歷任的傳教師有:
陳榮宗(1909~1913年)，柯安樂(1913~1914年)，
石安慎(1914~1918年)，陳溪圳(1918~1919年)，
徐春生(1919~1923年)，陳芳本(1922~1924年)，
蔡安定(1924~1926年)，郭樹枝(1926~1927年)，
侯連湖(1927~1929年)，康清塗(1929~1932年)，
曹添旺(1932~1934年)，袁新枝(1934~1956年)，
董群家(1956~1958年)，許再興(1959~1962年)，
陳瑞騰(1962~1964年)
四、明德街時代，1964~現今
(1)陳瑞騰傳道予1962年邁力鼓舞，購買了現址第一百多坪，當時的禮拜堂為舊式平房臨時修改使用。
(2)李長裕牧師1964年(1964~1972)就任本堂第二任牧師，有鑒於禮拜堂簡陋，雨來屋漏，即日發起「一日一元」運動，籌集56萬元，開工興建上下共128坪的新鐘樓式教堂。
(3)鍾瑞能傳道1972年(1972~1978)就任以來，人數漸增，主要因素板橋是台北區重鎮，工商發達，中南部紛紛遷居於此，許多中南部基督徒也遷到這裡定居。鍾瑞能牧師的時期，牧會目標努力整頓使他們成為有組織、有紀律有歸屬感於此的「基督精兵」。
(4)陳儀裕傳道(1979~1981)任期內，教會內的各種組織紛紛如雨後春筍般的成立，如媽媽合唱團、青年團契、成人主日學等相續成立。因此教會禮拜堂不敷使用，主日學學生增至一百多人，教室不夠用，合唱團沒有適合地方練唱，青少年團契沒有活動的地方，於是興起長執會重新增建的議決，也分設土城佈道所也就是土城教會，時間是1968年。本會開設了埔漧教會。1980年扶助新民教會申請升格堂會。
(5)許信一牧師(1981~1993)為第四任牧師，教會由鐘樓擴建，1988年教會陳光雄等弟兄姊妹發起重建，有一個寬廣的空間，十年樹木百年樹人的目標及多功能教堂。經與建築師研商設計地下一樓，地上六樓共400坪。
(6)夏德輝牧師(1993~2001).
(7)洪英俊牧師(2004/~2015/8).
(8)聘牧中...........
明德街時代
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